Usar OpenBabel para convertir sdf to pdb (entre otros)

%instalar OpenBabel en Debian Linux sudo aptitude install openbabel openbabel-gui

%ver formatos soportados obabel -L formats %ver formatos soportados

%comando de conversión de un sdf con múltiples moléculas a varios archivos pdb con los nombres de las moléculas obabel ambinter_natural_compounds_3D.sdf -O dummy.pdb –split